Ses Salines están catalogadas como LIC desde 2007.

El Consell de Formentera, a través de la Consellería de Medi Ambient, ha presentado alegaciones al borrador del plan de gestión del denominado Lloc d' Importància Comunitaria (LIC) de ses Salines de Eivissa y Formentera, elaborado por el Govern. Según expresó la titular del área, Silvia Tur, «el borrador del plan de gestión redactado por el Govern resulta incongruente, ya que describe un cuadro idílico en el que se afirma que, los 18 hábitats prioritarios y las 2 especies de protección estricta se encuentran es un estado de conservación excelente e ignora las amenazas con las que conviven». En este sentido Tur señaló que, «en lo que respecta a las praderas de posidonia el informe se contradice con los últimos estudios científicos llevados a cabo por la auditora Oceansnell, que en 2012 estimó que entre es Caló de s'Oli y Espalmador estas habían reducido su volumen entre un 16 y un 44 por ciento».

Para la consellera, «esta realidad idealizada del estado actual de la zona es preocupante porque puede ser perjudicial a la hora de definir los recursos y las actuaciones a llevar a cabo» y añadió que, «el texto tampoco menciona la presión de las excursiones marítimas, las party boats, los desembarcos no autorizados, el deficiente estado de los emisarios, las sustituciones de cableado submarino o las posibles autorizaciones para las prospecciones petrolíferas y si no se realiza un diagnóstico exacto y un reconocimiento de las amenazas y de la situación actual, siempre arrastraremos problemas para los que luego no habrá partidas económicas que los solucionen». Cabe recordar que el LIC de Ses Salines fue declarado en 2007 y es uno de los 11 espacios protegidos de Balears que la Conselleria de Mediambient de la Comunitat Autónoma declaró Zona de Especial Conservación (ZEC), por lo que desde el Consell estiman que el nuevo plan de gestión debe prever las acciones y los medios para preservar esta área.